Đối với các sàn thương mại điện tử có chức năng thanh toán, sàn thực hiện khấu trừ, kê khai và nộp thay thuế GTGT và thuế TNCN theo tỷ lệ % trên doanh thu. Trong khi đó, với các nền tảng không có chức năng thanh toán, cá nhân kinh doanh tự thực hiện nghĩa vụ kê khai và nộp thuế theo từng lần phát sinh, theo tháng hoặc theo quý.